
El proyecto trata de
conocer cómo funcionan las proteínas a nivel molecular utilizando
el procesador Cell de PLAYSTATION 3 como base, unos resultados
que pueden aplicarse en la lucha de enfermedades tan importantes como,
por ejemplo, el Alzheimer.
La simulación del comportamiento
de biomoléculas de dimensiones microscópicas es de una enorme dificultad
a la hora de diseñar algoritmos y arquitecturas de análisis, incluso
para los más modernos ordenadores. Su conocimiento resulta imprescindible
para que la medicina pueda hacer frente a patologías muy dañinas.
Para realizar dichas simulaciones, el equipo de la Unidad de Informática
Biomédica (GRIB) del IMIM-UPF decidió utilizar la potencia del procesador
Cell de PLAYSTATION 3.
El procesador Cell de
PLAYSTATION 3 es el resultado de los esfuerzos de investigación y
desarrollo de tres grandes firmas: Sony, Toshiba e IBM. Se trata de
ocho microprocesadores que trabajan a la vez coordinados por un noveno
microchip. Es la tecnología de los superordenadores al alcance del
consumo doméstico, un procesador capaz de hacer cálculos a una velocidad
muy superior a cualquier PC convencional. La capacidad de cálculo de
100 sistemas (PS3&trade
equivaldría a miles de ordenadores convencionales.
Los resultados que se
obtienen de esta investigación, son una importante base de estudio
para seguir avanzando en el conocimiento de muchas enfermedades: “El
proyecto PS3GRID es una infraestructura computacional general
que puede ser utilizada para estudiar cualquier tipo de proteína. En
este proyecto en concreto que llevamos a cabo con SCEE nos hemos enfocado
en proteínas relacionadas con el Alzheimer”, explica el profesor
Gianni De Fabritiis, coordinador de la investigación.
Para tratar de agilizar
la obtención de datos y buscando la colaboración de todos aquellos
que quisieran contribuir al desarrollo de la ciencia y que a su vez
tengan una PS3™, se puso en marcha a finales del año pasado la plataforma www.ps3grid.net. Desde esta dirección, en solo unos segundos,
cualquier usuario se puede descargar y grabar en un dispositivo USB
de 1Gbyte de espacio, el sistema operativo Linux Live y el software
PS3GRID.
Después solo hay que
cargar el software PS3GRID al sistema PLAYSTATION 3 con el dispositivo
USB donde se ha grabado dicho software. Una vez instalado en PS3™,
el software conecta directamente el sistema PLAYSTATION 3 del usuario
al servidor de PS3GRID descargando los cálculos científicos
que realizará PS3™. Dichos cálculos moleculares se realizarán a
una velocidad 16 veces superior a la de un PC normal, gracias al procesador
Cell, sin que el usuario de PS3™ tenga que hacer nada. Para volver
a jugar o utilizar PLAYSTATION 3 con otros fines, simplemente hay que
reiniciar el sistema.
Sony Computer Entertainment
España (SCEE) se une a esta investigación facilitando nuevas unidades
de PS3™ a los investigadores del proyecto PS3GRID
y financiando el seguimiento de su desarrollo y participación en el
análisis de datos. “Es un verdadero placer colaborar en un proyecto
tan prestigioso que confía sus investigaciones a la potencia del procesador
Cell de PLAYSTATION 3”, afirma James Armstrong, Vicepresidente Senior
del Sur de Europa y Consejero Delegado para España y Portugal. “No
podíamos dejar pasar la oportunidad de contribuir al progreso de la
ciencia en su búsqueda de curas para graves enfermedades”, añade
Armstrong.
Para saber más sobre el proyecto PS3GRID puede consultarse su página oficial en